La VMM coordonne la politique intégrée de l'eau. Elle surveille l'état des réseaux d'eau, gère les cours d'eau non navigables de première catégorie et les eaux souterraines, planifie et supervise les infrastructures de traitement et élabore des instruments politiques pour atteindre les objectifs environnementaux souhaités en matière d'eau.
La directive-cadre européenne sur l'eau, transposée dans le décret flamand sur la politique intégrée de l'eau, fixe entre autres l'objectif d'un bon état écologique pour les masses d'eau de surface. Les éléments de qualité biologique sont le phytoplancton, les macrophytes et le phytobenthos, macro-invertebraten et les poissons, et une série de paramètres hydromorphologiques et physico-chimiques déterminent l'état écologique.
L'objectif n'est presque jamais atteint. Un certain nombre de masses d'eau obtiennent déjà de bons résultats pour un ou plusieurs éléments de qualité biologique.
La situation s'améliore lentement.
